发酵床养鸡的利：
发酵床养鸡的好处同样地，与发酵床养猪相似，达到节省70%劳动力，节约用水，提高鸡肉品质，显著改善鸡的外观，显著降低发病率（特别是呼吸道疾病等），鸡舍几乎闻不到臭味，改善了劳作环境，与传统养鸡法相比有着天壤之别，并达到零排放，不污染环境，增加经济效益的目的。
由于体现了鸡的福利，减少了氨味对鸡的影响，满足了鸡的习性，鸡的抗应激能力大大增强，发病率大大减少，管理起来得心应手，这是发酵床养鸡给养殖户带到的最直观的好处。
一次建设可以使用3年以上，使用到期后的垫料也是优质的有机肥料。在发酵床养鸡舍内，只要保持有益微生物的优势，是很容易形成一个良性的微生态平衡的，整个鸡舍处于一个有益菌占绝对优势的环境中，清爽没有异味，有益菌已深入到环境中每一个角落，显著增强了鸡的非特异性免疫力，减少了用药量，从而靠自身的免疫力和环境微生物的帮助，达到了抵御疾病的目的，与传统的养鸡模式的臭气熏天，苍蝇满天，疾病不断等形成天壤之别。
发酵床养鸡不仅可以提高肉蛋品质，减少药残，提高出口创汇率的目的，还可以从本质上增强鸡只的品质，顺应了鸡的原始生活本质，如啄食沙砾，用脚刨地等原始生活习惯，例如鸡是有砂囊的，鸡的砂囊能将石头消化，其强烈的粉碎能力，由此可见一斑，若想增强鸡的消化吸收能力，应该在雏鸡时，就给鸡营造鸡原始的啄食沙砾，用脚刨地的环境，垫料中有木屑，可消化利用的玉米芯粉末、秸秆碎秆等，可充分锻炼鸡的砂囊和促进肠子生长的长度，在这种环境和条件下，可比一般普通的鸡盲肠的长度长三分之一。这样既强化了胃肠的消化功能又锻炼鸡的躯体和内脏，也杜绝了鸡的心理应激反应。
另外，我们知道，传统笼养鸡的消化道极短，这也是造成饲料消化不好，造成鸡粪中仍然含有大量营养物质，如鸡粪的粗蛋白仍然达到了28%左右的主要原因之一，在发酵床中饲养的家禽，消化道长三分之一，从而大大提高了鸡对饲料的消化吸收率，其结果就是：①饲料报酬大大提高，料肉比大大降低，效益大增；②排出的粪便臭味大大减少，减少了发酵床发酵粪便的压力，延长了发酵床的使用寿命和发酵效率；③鸡舍内的空气质量更好，鸡更加健康，最终形成一个良性循环。一只鸡节约的成本（相对于传统笼养肉鸡的饲料药物支出等）可达到5元之多。
发酵床养鸡的死亡率和淘汰率相对传统笼养鸡大大减少，即使是蛋鸡的死淘率也可控制在5%左右，肉鸡在2%左右。传统笼养鸡的肉味道已让广大消费者唯恐避之不及，传统笼养鸡肉的腥味突出，这是近年来消费者追寻农村土鸡的主要原因之一，而发酵床养出的鸡只，不仅肉质好，口味好，鸡肉中的营养价值也更高，所以，发酵床养鸡，给很多传统笼养鸡业者提供了一个更好的养殖模式选择，鸡只更好销售，售价也更高，效益更好。
发酵床养鸡存在的弊端问题：1 消毒防疫问题 很多人认为做好发酵床以后，不能进行正常消毒了，其实这是一个误区，许多养鸡户一直不敢使用常规消毒药对发酵床进行消毒，生怕影响微生物降解能力而造成死床，就此问题大兴区动物卫生监督管理局、北京农业职业学院专门进行了相关实验：分别采用二氧化氯、威特消毒王两种消毒药对其消毒后，发酵床0厘米，-5厘米，-15厘米上的细菌数量随着消毒后时间的增加，细菌数量呈现一个先下降后上升过程。下降的过程说明是消毒剂起作用杀灭细菌的过程，上升过程说明，随着消毒后时间的延长，消毒剂的作用降低，细菌开始复苏。不同取样层细菌数量在消毒后48小时分别恢复到了70%以上，普通的消毒对30厘米以下的垫料的细菌数量几乎没有影响。从理论上来讲，发酵床本身就有生物热消毒功能(故有“消毒床”一名)，中间层50℃左右的温度可杀灭绝大多数病原菌和虫卵，通过翻撬定期将表层垫料翻入中间层进行高温消毒，所以床体表面一般无需再用化学制剂消毒。 2 抗生素等药类使用问题 这是一个认识误区，发酵床只是一种给鸡换了一种福利化的生活环境，对养殖方法并没有做过多改变，正常的免疫程序必不可少，对发酵床也不会有任何影响。在发酵床环境养鸡，抗生素类药物可以逐渐用益生素类替代；饲料中的抗生素累积对垫料的影响可通过在饲料中添加某些有益菌来消除。 3垫料成本问题 根据地域不同，各种垫料价格差距较大。发酵床的垫料并不要求千篇一律，只要掌握好保水性与通透性垫料的配比，不同地区应充分考虑当地的区域资源优势，如石家庄周围的锯末、玉米芯；保定、衡水地区的花生壳；承德地区种蘑菇的菌棒；邢台、邯郸地区的棉花秸秆；京津唐地区的稻壳；山区的树枝粉碎等等。需要特别指明的是，玉米秸秆接触氧气易生黄曲霉菌，如要使用，在发酵池80厘米厚的情况下，可垫入发酵床底层不超过30厘米，并在日常管理翻撬时不要翻到50厘米以下，保证秸秆厌氧发酵环境。另外，部分发酵床菌种提供厂家本身有生物有机肥的生产、销售资质和渠道，可以提供垫料回收业务。 4日常管理问题 发酵床养鸡省时省力，比传统节约了很大的劳动量，尽管需要定期的翻动，相对传统养殖还是非常省力的，如果你垫料选择全部用锯末，属于保水性物质，长期使用容易板结，但是如果你用保水性和通透性物质合理搭配的话，发酵床可以一周甚至两周翻动一次。 5 使用年限问题 按理论计算：垫料理想使用天数=[(25-垫料碳氮比)×垫料总量×垫料含氮率]÷[(粪尿碳氮比-25)×(日产粪量×粪含氮率+日产尿量×尿含氮率]，在锯末和稻壳各一半的情况下，理论使用年限为4.06年，考虑一些不可测因素的影响，一般的发酵床使用2-3年是正常的。但使用年限受多种因素影响，一般注意以下几点可增加垫料使用年限：①垫料一定要完全发酵腐熟后再进猪使用，这也是对垫料的一个消毒过程；②饲料中添加一些微生态添加剂，既通过粪便随时对床体进行补菌，又对猪只本身的免疫力、饲料转化率有所提高；③按发酵床要求控制养殖密度，避免床体超负荷工作；④选择合格的发酵床菌种；⑤当垫料下沉超过10厘米时及时补料。