城乡居民医疗和灵活就业医疗区别主要体现在以下几个方面：
1、参保的人群不同：
没有固定工作单位的个人，可以以灵活就业人员身份自己缴纳职工医保，也就是灵活就业人员医保。而居民医保的参保人员是没有参加职工医保的人员，除了灵活就业人员以外，老人小孩等也能参加。
2、缴费的方式不同：
灵活就业人员如果缴纳的是职工医保，那么每月都需要缴纳医疗保险费用，一旦出现断缴，可能影响到医疗保险带来的保障。居民医保采用的是一年一缴费的制度，交一年费用，获得一年的医疗保障，错过了集中缴费时间可能无法补缴。
3、报销比例不同：
灵活就业人员缴纳的职工医保报销比例高，而城乡居民医保的报销比例相对较低。
4、医保账户不同：
灵活就业人员缴纳的职工医保通常会建立医保个人账户，每月有部分金额返还到医保个人账户中，可以用来在定点药店购买药品，也可以用来在定点医院看病消费，各地具体使用方法规定可能不同。城乡居民医保没有医保个人账户。
法律依据：《中华人民共和国社会保险法》第二十三条
职工应当参加职工基本医疗保险，由用人单位和职工按照国家规定共同缴纳基本医疗保险费。
无雇工的个体工商户、未在用人单位参加职工基本医疗保险的非全日制从业人员以及其他灵活就业人员可以参加职工基本医疗保险，由个人按照国家规定缴纳基本医疗保险费。